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砍花法种植香菇对树种的要求非常严格，椴木香菇对树木的要求也比较高，只有壳斗科、桦木科、金缕梅科等部分树种种植效益较好，而且必须是成型的主干。
在引入了木屑袋料栽培后，才真正放宽了对木料的限制。袋料种植不仅可以利用阔叶林中的绝大多数树种，而且可以广泛地利用枝桠、枝条、边材和废料，农作物中的棉籽壳、玉米芯、甘蔗渣、稻草、小麦秸、玉米秸、大豆秸、高粱秸、棉花秸、米糠、谷糠也可利用，甚至针叶林中的松杉树木屑经过特殊处理后也可利用。这样在椴木种植中不能被利用的质地不致密的树种如杨树、苹果树等也可作为原料，极大地扩大了香菇的原材料来源。但目前的种植还是以质地比较坚实的阔叶林为主，因为它们的种植效益最好，也只有这些原材料可以独立使用，其它类型的原料都必须和这些主料混合使用。一个地方，根据当地的资源情况，研究合理料物配比，充分利用当地辅助原料，减少对林木的消耗，是香菇可持续发展的必由之路。
我国菇树资源丰富，据不完全统计，目前栽培上常见的有9个科8个属的多个种，其中主要的菇树树种有：麻栎、栓皮栎、槲栎、枹栎、蒙古栎、乌冈栎、茅栗、锥栗、毛栲、钩栲、甜槠、刺栲、小红栲、罗浮栲、青冈栎、水青冈、枫香树、蕈树、细柄蕈树、蚊母树、千金榆、大穗鹅耳枥、鹅耳枥、旱冬瓜、水冬瓜、水青冈、山杜英、猴欢喜、山乌桕。
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