原因分析
1.基质配比不当
Ｃ／Ｎ过低：为促进菌丝健壮、旺盛而过多添加麦麸、豆饼之类作为氮源，导致较高的营养物质为杂菌提供了良好的繁殖生长条件，该类菌种即使不污染，也会使菌丝徒长、结厚菌皮而不利于正常出菇。
2.装袋与灭菌的时间距离偏长
基料酸败，高温季节进行的装袋操作，基料在袋内不断产热、产酸，及时灭菌可杀死微生物活体，否则，一旦时间拖长，产酸量增多，即使灭菌彻底，接的菌种也无法生长，时间稍长便会被杂菌趁虚而入。灭菌不彻底或常压灭菌迟迟不能达到设定温度。
3.塑袋不合格
或操作不慎塑袋破裂：购买再生料或不合格塑袋，或装料、运输等环节扎破、碰破塑袋，杂菌从破洞处进入。
其它原因：接种箱熏杀不彻底、不足时；所用种源未经严格检查；种源外壁沾附杂菌而未经消杀处理直接入箱；操作人员随便出入接种室（箱）等。接种场所不洁、湿度过大、温度过高、通风不良，所处环境污染严重等。
实用措施
1.及时将污染袋挑出后倒袋，将料晒干，再生产时可按１：１比例与生料混合，以减少浪费。（发生链孢霉时不可用此法，应立即将菌袋深埋或焚烧。）
2.选择大企业的合格聚丙塑袋，拒绝透明度差、硬度大、厚薄不匀的不合格塑袋。
3.尽量选择机械装袋，并在装袋完成前1小时即开始生火升温，使水沸后再行排袋灭菌，效果最好；也可生大火后及时排袋，大火猛攻，使在很短时间内达到规定的１００℃，不可拖长时间。
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